在武汉补办机动车登记证书的流程如下：

准备材料

机动车所有人的身份证明原件和复印件。

《机动车牌证申请表》。

机动车查验记录表（当场办理）。

如果机动车登记证书遗失，还需提供行驶证和机动车的标准照片一张。

车辆查验

携带所需资料，开车到车辆注册地车管所办理。

车辆通过专门的查验通道，直接到查验点开始查验车辆。

车管所工作人员对车辆进行查验，完成后车主需要到查验服务处确认信息。

办理手续

携带受理凭证到业务大厅导办服务台装订手续，排队等待办理。

在等候区等待叫号办理业务，然后到对应窗口进行办理。

缴费和领取证书

携带受理凭证到收费窗口交费。

到取证窗口打印机动车登记证书，补办完成。

需要注意的是，机动车所有人应本人到场申请，不能委托他人代理。如果因死亡、出境、重病残和不可抗力等原因不能到场，应当出具相关证明。

建议提前准备好所有所需材料，并确保车辆信息准确无误，以便顺利完成补办手续。