根据香港车在内地滞留超过三个月的处理规定，车主需通过以下方式办理延期申请：

一、延期申请方式

线上申请

通过海关官网、微信公众号或粤港两地海关合作平台提交延期申请，需提交车辆备案地海关要求的相关证明文件（如延期理由说明、临时行驶车号牌等）。

线下申请

拨打海关办事窗口电话或前往备案地海关提交纸质材料，部分城市（如拱北海关）支持通过电话或邮箱提交申请材料。

二、申请时间要求

延期申请需在车辆备案地海关规定的停留期限届满前提交，通常为30个工作日内。

三、所需材料

车辆登记证书、行驶证原件及复印件；

车辆备案证明；

延期原因说明（如突发情况、维修等）；

相关证明文件（如医院证明、维修发票等）。

四、注意事项

超期滞留处罚

若车辆逾期未归，将面临罚款（约车辆市场价格的0.9%）或强制拖车处理。

年审影响

粤港车牌年审以末次入境时间计算，若连续两年未归，可能影响年审资格。

政策时效性

以上信息基于2021-2023年政策，建议办理前通过海关官网或官方合作平台确认最新规定。

五、补充说明

若因特殊原因无法按时返回，可联系海关说明情况申请特殊处理；

香港车回港验车需配合香港运输署要求，确保车辆符合内地检验标准。

建议办理前通过拱北海关官网（www.guangbo.gov.cn）或粤港海关合作平台查询最新政策，确保材料齐全。