蓝牌电动摩托车闯红灯的处理方式如下：

记分处罚

驾驶机动车违反道路交通信号灯通行的，一次记6分。

罚款处罚

罚款金额通常为200元。

其他可能措施

如果电动车上牌时属于机动车类型，且驾驶人拒绝接受罚款处罚，交通管理部门可以扣留其非机动车。

综上所述，蓝牌电动摩托车闯红灯会被扣6分，并处以200元的罚款。建议驾驶人员遵守交通规则，避免闯红灯等违法行为，以免受到处罚。