C1和D照合并后存在以下影响：

记分系统：

合并后的驾驶证记分只能记12分，而不是分别记24分。这意味着无论是驾驶C1准驾车型的机动车还是D准驾车型的机动车违章，扣分都会累积在这个合并的驾驶证上。一旦累积满12分，驾驶人就需要去参加科目一的考试。

年审影响：

虽然D和C1本身没有年审，只需六年换证一次，但是合并后共用12分，不论是开车还是骑车扣分都是记在一起的。这可能导致驾驶人在不知不觉中就累积了大量扣分，从而影响驾驶证的有效期。

准驾资格影响：

如果驾驶人在驾驶一种车型时发生了违章或吊扣，那么另一个准驾资质也会受到牵连。这可能会给驾驶人带来不必要的麻烦和损失。

有效期：

合并后的驾驶证有效期按照第一次取得驾驶证的日期算的起始日期保持不变，在有效期满前90天内要记得换领。

综上所述，虽然C1和D照合并可以带来一些便利，例如增加驾驶人的准驾车型，但同时也带来了记分系统和准驾资格的限制，使得违章行为和驾照吊销的影响更加广泛。因此，在决定是否合并C1和D照时，驾驶人需要权衡这些利弊。