C1和C2科目三考试的主要区别体现在以下几个方面：

考试车辆不同

C1考试使用的是手动挡汽车，考生需要熟悉手动挡车辆的离合器、油门和刹车踏板操作，并通过熟练切换挡位来控制车速。

C2考试使用的是自动挡汽车，无需处理离合器操作，考生仅需掌握油门和刹车即可。

考试内容不同

C2科目三的考核更侧重于实际道路驾驶技巧，由于自动挡的特性，加减挡换挡环节被省略。

C2的考试也不会包括坡道定点停车和起步，因为这些在自动挡车辆上无需单独操作。

操作难度不同

C1考试由于需要手动换挡，操作相对复杂，难度较高。

C2考试由于无需手动换挡，操作简单，难度相对较低。

准驾车型不同

C1驾驶证涵盖了小型、微型等多种车型，允许驾驶者在多种场合下行驶。

C2驾驶证则更为专一，只适用于自动挡车辆，主要涵盖小型和微型自动挡载客及轻型、微型自动挡载货汽车。

总的来说，C1和C2科目三考试的区别主要体现在考试车辆、操作内容、难度以及准驾车型上。选择哪种驾照主要取决于个人驾驶习惯和需求。如果喜欢操作感或未来有手动挡汽车的需求，可以选择C1；如果希望驾驶更为简便的自动挡车辆，则C2更为合适。