当C1驾驶证在一年内被扣满12分时，驾驶员需要按照以下步骤处理：

扣留驾驶证

公安机关交通管理部门会扣留驾驶证，驾驶员暂时不能驾驶机动车。

参加学习

驾驶员需要在15日内到机动车驾驶证核发地或者违法行为地的公安机关交通管理部门参加为期7天的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。

参加考试

完成学习后，车辆管理所会在20日内对驾驶员进行道路交通安全法律、法规和相关知识考试。

如果考试合格，记分会被清除，并且驾驶证会被发还。

如果考试不合格，驾驶员需要继续参加学习和考试，直到合格为止。

缴纳罚款

驾驶员需要缴纳因违法行为产生的罚款。如果交警已经开具了罚单，驾驶员可以前往指定的违法罚款缴纳点进行罚款缴纳。

处理逾期罚款

如果驾驶员未在规定的时间内处理罚款，将会产生滞纳金，这可能会影响换证、理赔和年审。

申诉

如果驾驶员认为被误扣分，可以通过申诉来补回分数。

建议：

驾驶员应尽快处理违章记录，参加学习和考试，以便早日恢复驾驶资格。

驾驶员应认真备考，确保在考试中取得合格成绩。

驾驶员应确保在规定的时间内完成所有步骤，以避免额外的麻烦和费用。