厦门车牌在泉州市区违章可以在 泉州市区任一交警队或行政综合处理大厅处理。车主需携带驾照和行驶本前往车辆违章地或车辆注册地的交警队或行政综合处理大厅进行违章处理。如果违章没有扣分，可以直接通过网上缴纳罚款，如使用支付宝等；如果违章有扣分，则必须先去交警队确认违章和扣除分数后，才能缴纳罚款。

建议您根据最新的交通管理规定和实际情况选择合适的处理方式，以确保违章能够及时、顺利地得到处理。