根据驾考相关规定和搜索结果，科目一考过但未完成科目二/科目三考试且超过三年有效期的处理方式如下：

一、核心处理原则

三年有效期从学习驾驶证明核发之日起计算

只有通过科目一考试并取得学习驾驶证明后，才开始计算三年有效期。若未完成后续科目考试，已通过科目一的成绩作废。

档案与记录重置

若超过三年未通过全部科目，需重新报名，原有学车记录和档案将清零。

二、具体处理方式

因学员个人原因超过三年

- 若完全因学员自身原因（如放弃考试）导致超期，驾校通常不退还培训费。

- 驾驶员需重新选择驾校并开始完整学车流程。

因驾校原因未完成培训

- 若因驾校未安排科目二/科目三培训（如60天内未组织考试），根据合同条款，驾校应退还已缴纳的培训费。

- 驾驶员可要求与驾校协商延长培训时间或解除合同。

三、注意事项

合同条款的约束性：

建议签订合同时仔细阅读关于学考时效和退费条款，避免因条款模糊引发纠纷。

优先预约政策：若驾驶证到期不足6个月，可在预约考试时选择剩余空闲名额，避免重复缴费。

重新报名的费用：需承担新课程的培训费，费用标准因地区和驾校而异。

四、建议操作步骤

联系驾校确认：

告知驾校超期情况，要求提供退费依据或延长培训方案。

收集证据：

保留与驾校的沟通记录、合同副本等，作为后续维权的依据。

重新规划学考：

根据自身时间安排，选择合适的学习进度并报名新课程。

若与驾校协商无果，可向当地交通管理部门投诉或通过法律途径解决。