根据我国驾驶证考试相关规定，若已通过科目一、科二、科三但未通过科四，且超过三年未完成全部考试，需按以下步骤处理：

一、考试有效期与成绩作废规则

三年有效期的起始时间

从科目一考试合格后核发学习驾驶证明的当天开始计算。

科目四未考的影响

若三年内未通过科四，已通过的科目一、科二、科三成绩将全部作废。

二、具体解决方案

重新报名并参加全部考试

- 需重新缴纳报名费，选择驾校或考场报名。

- 按照考试流程完成剩余科目（科四）的考试。

特殊情况处理

- 若未参加过科目一考试，直接进入下一阶段考试，无需再考科目一。

- 若已通过科目一但剩余科目未考，部分机构可能要求补考，具体以驾校要求为准。

三、注意事项

合同条款确认

- 驾考前应仔细阅读与驾校签订的合同，确认是否有关于超期处理的特殊条款（如延期费、违约金等）。

费用与时间成本

- 重新考试需承担培训费、报名费及考试费，总费用可能较高。

- 建议优先安排时间，避免再次超期。

四、补充说明

若因特殊原因（如健康问题、失业等）无法及时考试，可咨询当地车管所或驾校，了解是否可申请延期或补考。

驾考内容主要涉及交通法规、驾驶技能及安全意识，建议通过驾校系统学习或自主复习，提高通过率。

综上，超过三年未通过全部科目的唯一解决方案是重新报名并参加全部考试，期间需注意合同条款及费用安排。