根据相关法律法规，车辆脱审超过两年的处理方式如下：

一、车辆档案处理

直接注销

若车辆连续超过两年未进行年检，车管所将直接注销车辆档案，车辆将无法上路。

强制报废风险

若车辆超过三年未年检，可能面临强制报废处理，但部分情况下需先补缴罚款或完成其他手续。

二、恢复档案的必要条件

缴纳罚款

需向车管所缴纳罚款后方可申请恢复档案。具体罚款金额可能因地区政策不同有所差异，但通常在50-200元之间。

补审手续

恢复档案后，需按照车辆登记地车管所的要求办理补审手续，包括提交身份证明、车辆购置税证明等材料。

三、其他注意事项

驾驶证影响

若车辆脱审导致驾驶证被注销，需重新考取驾驶证后方可上路。

事故责任承担

脱审期间发生交通事故，车主需承担全责。

避免逾期风险

建议车主至少提前三个月申请年检，避免因突发情况导致逾期脱审。

四、法律依据

《中华人民共和国道路交通安全法》

第九十条：机动车未按照规定进行年检的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。

《机动车登记规定》

第四十九条：机动车所有人可在检验有效期满前三个月内申请检验合格标志。

建议车主尽快联系车管所处理脱审问题，避免因逾期导致更严重的法律后果。