根据搜索结果，济南摩托车驾驶证考试建议考D证，主要原因如下：

一、准驾车型覆盖范围

D证

- 可驾驶普通三轮摩托车、普通二轮摩托车、轻便摩托车，以及E证和F证准驾的车型。

- 覆盖范围更广，未来若需驾驶三轮摩托车无需重新考证。

E证

- 仅能驾驶普通二轮摩托车和轻便摩托车，无法驾驶三轮摩托车。

二、考试成本与实用性

考试内容：

D证和E证考试内容相同，均包含理论知识和实操技能，难度相当。

长期价值：D证包含E证准驾车型，未来若需升级车型无需重复考试，性价比更高。

费用差异：两者考试费用基本一致，考D证无额外经济负担。

三、其他考虑因素

驾驶需求：若当前仅需驾驶两轮摩托车，E证已足够；若未来可能驾驶三轮摩托车，则D证更合适。

政策规定：根据最新交规，D证是三轮摩托车的法定要求。

综上，考D证是更全面、实用的选择，尤其适合计划在济南长期驾驶摩托车的用户。