C2驾照比C1驾照收费贵的主要原因有以下几点：

学员数量少，成本高：

由于学习C2驾照的人数相对较少，驾校需要承担的培训成本较高，因此收费也更高。

教练车较少，均摊成本高：

相比手动挡车，自动挡车的教练车数量较少，导致均摊成本上升，因此学费也会相应提高。

自动挡油耗高，费用较高：

自动挡车的油耗通常比手动挡车高，这增加了驾校的运行成本，因此也会反映在学费上。

自动挡车辆价格高：

自动挡车辆的价格普遍高于手动挡车辆，这也是C2驾照成本增加的一个原因。

教练资源分配：

由于C2学员数量少，教练在C2驾照培训上的投入成本相对较高。

车辆保养费用高：

自动挡车辆的结构较为复杂，特别是变速箱，其维护成本和修理费用通常高于手动挡车型。

综合以上因素，C2驾照比C1驾照贵的原因主要是因为学习人数少、教练车少、油耗高、车辆价格高、教练资源分配以及车辆保养费用高等因素导致的成本增加。