绍兴柯桥电动自行车黄牌和绿牌的区别主要体现在以下几个方面：

牌照颜色和意义

绿牌：代表电动车符合新国标标准，是非机动车，可以在市区内长期通行。

黄牌：代表电动车属于机动车范畴，包括已购买的各类老旧、违规电动车，分为两种情况：一是列入国家机动车产品目录的电动车，使用期限为长期；二是未列入国家机动车产品公告目录的临时过渡期间发放的黄牌，使用期限通常为三年。

使用范围和期限

绿牌电动车：可以在市区内通行，使用期限为长期。

黄牌电动车：使用期限分为两种情况，一种是长期，另一种是三年过渡期，过了过渡期后车辆不能上路行驶。

管理规定

绿牌电动车：按非机动车标准管理和处罚。

黄牌电动车：按机动车标准管理和处罚，驾驶黄牌电动车需要相应的驾驶证（如E证或F证）。

标准上的差异

绿牌电动车：符合国标标准，可以一直行驶。

黄牌电动车：不符合国标标准，包括超标车和电动摩托车等，需要符合特定条件（如电压和车速）才能申请。

综上所述，绍兴柯桥电动自行车黄牌和绿牌的主要区别在于牌照颜色、代表的意义、使用范围和期限、管理规定以及标准上的差异。建议根据电动车的具体情况和当地政策选择合适的牌照类型，并遵守相应的管理规定。