在新疆，申请C5驾照体检的医院包括以下几家：

哈密市中心医院；

和田地区人民医院（西院区）与 和田县人民医院；

乌鲁木齐市妇幼保健院；

乌鲁木齐市友谊医院青年路分院；

水磨沟区人民医院；

新疆维吾尔自治区儿童医院健康保健管理中心；

新疆医科大学第一附属医院；

新疆自治区人民医院；

新疆人民医院；

新疆维吾尔自治区中医医院。

建议选择离您居住地最近的医院或体检中心进行体检，以确保体检的便捷性。