石材生产企业的主管部门涉及多个监管部门，具体职责需根据企业生产环节和地域政策进行划分，主要分为以下几类：

一、主要监管部门及职责

生态环境主管部门

负责石材生产加工及矿山开采的扬尘污染防治统一监督管理，包括物料堆场扬尘控制、矿山生态恢复等。

自然资源部门（原国土局）

监督管理矿产资源勘查、开采活动，确保合法合规。

工业和信息化部门（原经信委）

推广石材废物综合利用工艺，指导企业技术改造和智能化升级。

发展和改革部门

制定行业发展规划，审核相关项目投资。

市场监督管理部门

监督企业生产、销售行为，保障市场秩序。

安全生产监督管理部门

负责矿山安全生产技术指导与监督管理。

地质矿产主管部门

全国矿产资源勘查、开采的主管部门。

交通运输部门

监督石材运输过程中的污染防治。

二、其他相关管理部门

环保局：

负责环境影响评价、排污许可等环境监管。

安全管理局：审批安全生产相关手续。

税务部门：办理税务登记及纳税监管。

三、地方性监管机制

部分地方政府（如南安市）可能建立特色监管机制，例如乡镇政府负责基层监管，工信局推动技术改造，形成多部门联动的监管体系。

四、企业需办理的手续

工商登记：核名并办理营业执照。

环评手续：荒料加工企业需完成环境影响评价。

安全审批：通过安全生产许可证审批。

总结：石材生产企业需同时接受环保、国土、工信等多部门监管，具体分工需结合企业规模、生产工艺及所在地政策确定。建议企业建立合规体系，主动对接相关部门，确保合法运营。