当您在超市购买的整箱酒中发现有空瓶时，可以采取以下步骤来解决问题：

与商家协商

首先，您应该回到超市，向销售人员说明情况，并要求更换一箱新的酒或者补偿一瓶酒。

如果商家同意，问题可以快速解决。如果商家不同意，您可以进一步采取其他措施。

投诉至消费者协会

如果与商家协商未果，您可以向当地的消费者协会投诉。消费者协会会根据您的情况进行调解，并可能帮助您解决问题。

法律途径

如果以上方法都无法解决问题，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。根据《食品安全法》和《消费者权益保护法》，您有权要求赔偿损失，并可要求支付价款十倍或损失三倍的赔偿金。

您可以咨询专业律师，了解具体的法律程序，包括收集证据、撰写诉状和选择法院等。

回收利用

作为另一种选择，您可以将空瓶送往专门的回收站点或回收中心进行回收。这样不仅可以减少资源的浪费，还对环境有益。

垃圾分类处理

如果您选择不追究赔偿，可以将空瓶进行垃圾分类处理。根据当地的垃圾分类规定，将空瓶与其他玻璃制品一起分类投放。

建议

及时行动：发现问题后应尽快与商家沟通，以免错过解决问题的最佳时机。

保留证据：如果需要采取法律途径，保留好购物凭证和相关证据，以便在需要时提供证明。

了解法律：熟悉相关的法律法规，了解自己的权益，以便在维权过程中更有力。

通过以上步骤，您应该能够妥善解决超市购买的整箱酒中空瓶的问题。