被扣12分后，重考科目一有 两次机会。具体规则如下：

考试机会：

科目一考试有一次机会，如果第一次考试未通过，可以当场进行补考，总共两次机会。

补考规则：

第一次考试不过的当场可以补考一次，两次都不过的，需要重新参加学习并按照相关规定继续考试。

法律依据：

根据《机动车驾驶证申领和使用规定》第六十八条，机动车驾驶人在一个记分周期内累积记分达到12分的，应当按规定参加学习、考试。考试合格的，记分予以清除，发还机动车驾驶证；考试不合格的，继续参加学习和考试。

因此，扣12分后重考科目一有两次机会，建议认真复习考试内容，争取一次通过考试。