C1和D照合并后， 总共有12分，而不是将扣分连在一起。具体规定如下：

合并后的驾驶证：

C1D驾驶证是将C1驾照和D驾照合并后的一本驾驶证。

扣分规则：

无论是驾驶C1驾照还是D驾照，扣分都会记在C1D驾驶证上。按照最高级别的驾照记分，如果驾驶其中一种车型违反了交规，扣分就记在最高级别的驾照上。

记分周期：

记分周期为12个月，从驾驶证上的初次领证日期起算。在一个记分周期内没记满12分且已交清罚款，下一记分周期开始时记分系统会将上一记分分值清零，否则累入下一记分周期。

因此，C1和D照合并后，扣分是合并计算的，总共有12分。如果在一个记分周期内扣分达到12分，驾驶证将被暂扣，需要参加学习和考试。