关于退驾驶证报名费时违约金的合理扣除比例，需根据具体情况和合同约定综合判断，具体分析如下：

一、违约金比例的合理范围

一般情况

根据商业惯例和《民法典》规定，违约金比例通常控制在合同总金额的30%以内。若超过30%，可能被认定为过高。

特殊比例参考

- 未参加考试：部分机构收取20%-50%违约金（如科目一未考扣400元）；

- 已参加部分课程：扣除对应课程费用（如已学部分按比例扣）。

二、扣除金额的判定依据

学员责任（单方面违约）

- 未参加考试或体检：通常扣除20%-50%费用；

- 已预约未考试：扣除150-350元（含建档费、服务费）；

- 科目一未通过：扣除400元（含建档费、服务费及理论培训费）。

驾校责任（服务缺陷）

若因驾校教学质量问题或管理不当导致退学，学员可要求全额或部分退款，违约金比例可能降低或免除。

三、协商与法律途径

协商原则

退费金额应结合学员实际学习进度、课程费用及合同约定确定。建议双方友好协商，可参考以下方案：

- 未学习：扣除20%-30%费用；

- 已学习：按实际消耗费用扣除。

法律救济

若协商失败，学员可依据《民法典》约定或当地消费者权益保护法规，要求减少违约金或赔偿损失。建议保留沟通记录作为证据。

四、注意事项

合同条款：

具体比例和扣除标准以签订合同时的约定为准；

时效性：超过1年可能影响维权时效，建议及时处理退费请求。

综上，违约金比例需在20%-50%范围内，并根据违约方责任、学习进度及合同约定综合确定。建议通过协商或法律途径解决争议。