当驾驶证的分数被扣完时，驾驶员需要按照以下步骤进行处理：

参加学习：

驾驶员需要在15日内到交通管理部门参加道路交通安全法律、法规和相关知识的学习。

参加考试：

学习完毕后，驾驶员需要参加道路交通安全法律、法规和相关知识的考试。

考试合格：

考试合格后，记分将被清除，驾驶证将发还。

具体操作步骤如下：

驾驶证分数扣完后，驾驶员需在15日内到当地公安机关交通管理部门或驾驶证核发地参加为期7天的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。

学习结束后，驾驶员需要参加相应的考试，考试内容包括道路交通安全法律、法规和相关知识。

如果考试合格，记分将被清除，驾驶证将发还。

需要注意的是，如果在一个记分周期内有两次以上超过12分，驾驶员需要进行路考。此外，如果驾驶员拒绝参加学习或考试，交通管理部门将停止使用其机动车驾驶证。

因此，建议驾驶员在驾驶证分数扣完后，尽快参加学习和考试，以便早日恢复驾驶证的正常使用。