一次性扣12分原来没处理的违章 不会自动清除。根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，只有处理完违章违法行为，才能恢复相应的分数。此外，系统会自动清零上一周期的扣分记录，但这只是清除驾照上的扣分记录，而不是消除违章记录本身。

具体来说，如果驾驶证一次性扣除12分，或者在一个记分周期内累计扣除12分，会被降级。机动车驾驶人在一个记分周期内累积记分达到12分的，公安机关交通管理部门应当扣留其机动车驾驶证，并需要参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习，考试合格后，记分予以清除，发还机动车驾驶证。

因此，如果驾驶证被一次性扣12分，需要及时处理违章记录并缴纳罚款，才能恢复驾驶证的正常使用。未处理的违章记录不会自动清除，会一直存在并可能影响驾驶证的使用。